El Código Sanitario para los Animales Acuáticos de la OIE enumera las enfermedades infecciosas de importancia y significancia en la acuicultura mundial y la producción acuática. Todos ellos son causados por patógenos (virus, bacterias y parásitos) y son capaces de difundir a través del movimiento de las especies huésped infectadas. Además de las enfermedades de la lista de la OIE, hay muchas enfermedades de interés regional o nacional, que tienen un impacto significativo en la productividad. Algunos de ellos son bien estudiados y comprendidos, mientras que otras son de origen desconocido o emergentes. Estas enfermedades pueden plantear retos iguales, si no mayores, para eldesarrollo de la acuicultura en algunas regiones.
Las enfermedades no infecciosas son también comunes en la acuicultura y, a pesar de que generalmente reciben menos atención que las enfermedades exóticas, pueden tener efectos igualmente devastadores sobre la producción en un muy corto plazo. Estas enfermedades son causadas generalmente por agentes oportunistas u otras condiciones bióticas y abióticas. Por ejemplo, la gestión inadecuada, mala calidad del agua, nutrición inadecuada, la degradación del medio ambiente acuático, y la exposición crónica o aguda a la contaminación han sido vinculados a la mortalidad en masa de una amplia gama de especies de cultivo y silvestres.
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